O Setor de Conformidade é composto pela Conformidade Contábil e pela Conformidade de Registro de Gestão (CRG).
A Conformidade Contábil certifica, ao analisar os atos e fatos contábeis da gestão orçamentária, financeira e patrimonial da UFLA, a adequação deles às normas vigentes. A certificação garante com razoável segurança que tais atos, fatos e demonstrações estejam de acordo com os padrões das Normas Brasileiras de Contabilidade Aplicadas ao Setor Público (NBCASP), com a Lei nº 4.320/1964 e com o Manual SIAFI.
Por sua vez, a Conformidade de Registro de Gestão (CRG) segue a Instrução Normativa nº 06 de 2007 da Secretaria do Tesouro Nacional (STN). A CRG verifica se os registros dos atos e fatos da execução orçamentária, financeira e patrimonial efetuadas pela UG Executora foram executados em observância às normas vigentes e a existência de documentação que suporte as operações registradas.