A Coordenadoria de Contabilidade e Controle é vinculada a Diretoria de Contabilidade - DCont e suas atribuições estão elencadas no regimento interno desta diretoria. Esta Coordenadoria é responsável, principalmente, por acessorar a DCont, analisar e gerar as demonstrações e relatórios contábeis, mater as certidões atualizadas e realizar as prestações de contas dos TEDs e convênios.